С помощью эмулятора iBCS2 система Linux позволяет выполнять загружаемые программы из систем SCO Unix, Xenix V/386, SVR3 generic, Wyse V/386, SVR4 (Unixware, USL, Dell), BSD/OS, FreeBSD. Например, в Linux работают такие приложения SCO Unix как CorelDraw, WordPerfect, Oracle.

В стадии разработки находится система WINE, которая позволяет запускать в X Windows прикладные программы MS Windows. При этом система MS Windows не используется и ее наличие не требуется.

Linux использует стандартную схему разделов диска и может разделять жесткий диск с другими системами, в т.ч. с DOS. Имеется загрузчик, который позволяет выборочно загружать требуемую ОС с диска.

Ряд фирм производят версии коммерческого программного обеспечения для Linux. Вот некоторые примеры:

В составе Linux работают